Makoto Naegi ist ein Glückspilz: in einer Lotterie gewinnt er die Aufnahme auf der Hope‘s Peak Academy, einer renommierten Eliteschule, die nur die Besten der Besten aufnimmt: Super-Genies, Super-Athleten, Super-Idole bis hin zu Bandenführern und Computernerds. Doch Makotos Glück ist nur von sehr kurzer Dauer. Denn gleich nachdem er das Gebäude der Hochschule betreten hat, findet er sich in einem mörderischen Spiel wieder. Zusammen mit vierzehn weiteren Neuschülern wird er vom Direktor der Akademie, dem sadistischen Teddybären Monokuma, im Schulgebäude gefangen gehalten. Die einzige Möglichkeit, der Situation zu entkommen: Sie müssen einen ihrer Mitschüler töten!